Bioinformatik: Ein Leitfaden fur Naturwissenschaftler

این راهنما که به شیوه ای آرام و قابل درک نوشته شده است، اصول و امکانات تحلیل توالی را معرفی می کند.

این کتاب با مقدمه‌ای بر پایگاه‌های داده‌های متوالی مهم در NCBI و EMBL، و همچنین بدنه رو به رشد پایگاه‌های داده موتیف آغاز می‌شود. سپس ساده‌ترین روش‌های مقایسه توالی زوجی در ترازهای سراسری و محلی و همچنین رایج‌ترین روش‌های اکتشافی جستجوی پایگاه داده (FASTA و BLAST) توضیح داده می‌شوند. ترازهای چندگانه، ماتریس های جایگزینی و محاسبه درختان فیلوژنتیک به خواننده معرفی می شوند. همچنین توضیحات جدیدی در مورد اصول تجزیه و تحلیل ژنوم و رایج ترین الگوریتم های پیش بینی ژن ارائه شده است. ابزارهای آنلاین در اینترنت یا نرم افزارهای رایگان برای هر روش مشخص شده است.

این کتاب برای کاربران و مبتدیان بیوانفورماتیک، به ویژه دانشجویان و محققانی که باید با تجزیه و تحلیل توالی سر و کار داشته باشند، طراحی شده است.

Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Grundlagen und Möglichkeiten der Sequenzanalyse ein.

Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschließend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben.

Das Buch richtet sich an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik, speziell Studenten und Forscher, die sich mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen.