Bacterial Molecular Networks: Methods and Protocols

نمایش‌های مبتنی بر شبکه در بیشتر زمینه‌های زیست‌شناسی فراگیر شده‌اند. شبکه‌های مولکولی باکتریایی: روش‌ها و پروتکل‌ها توضیحات معتبری از روش‌های تجربی و محاسباتی مختلف ارائه می‌دهد که امکان توصیف و تحلیل شبکه‌های برهمکنش مولکولی را با تمرکز بر باکتری‌ها فراهم می‌کند. این جلد به سه بخش راحت تقسیم شده است، این جلد پوشش گسترده ای از رویکردهای مختلف تجربی و در سیلیکو با هدف توصیف اجزای شبکه ارائه می دهد، به ارائه رویکردهای محاسباتی برای تجزیه و تحلیل توپولوژی شبکه های مولکولی می پردازد، و بیشتر معرفی می کند. روش‌ها و ابزارهای مختلفی که دانشمندان را قادر می‌سازد تا مدل‌های دینامیکی کمی یا کیفی فرآیندهای مولکولی در باکتری‌ها را تولید کنند. که در قالب بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی™ نوشته شده‌اند، فصل‌ها شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های گام به گام و به آسانی قابل تکرار و یادداشت‌هایی در مورد عیب‌یابی است. و اجتناب از تله‌های شناخته شده.

معتبر و قابل دسترس، شبکه‌های مولکولی باکتریایی: روش‌ها و پروتکل‌ها عمدتاً برای دانشجویان فوق‌لیسانس و محققانی در نظر گرفته شده است که در حوزه میکروبیولوژی تجربی و محاسباتی و ترکیبی از بررسی های به روز را همراه با پروتکل های دقیق نوشته شده توسط توسعه دهندگان منابع بیوانفورماتیک، مانند پایگاه های داده و ابزارهای نرم افزاری ارائه می دهد.

Network-based representations have become pervasive in most fields in biology. Bacterial Molecular Networks: Methods and Protocols provides authoritative descriptions of various experimental and computational methods enabling the characterization and analysis of molecular interaction networks, with a focus on bacteria. Divided into three convenient sections, this volume provides extensive coverage of various experimental and in silico approaches aiming at the characterization of network components, addresses the presentation of computational approaches to analyze the topology of molecular networks, and further introduces a variety of methods and tools enabling scientists to generate qualitative or quantitative dynamical models of molecular processes in bacteria. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and accessible, Bacterial Molecular Networks: Methods and Protocols is intended primarily for post-graduate students and researchers working in the field of experimental and computational microbiology and provides a combination of up-to-date reviews along with detailed protocols written by the developers of bioinformatics resources, such as databases and software tools.